STIKES Bethesda Yakkum memiliki fasilitas yang memadai untuk kegiatan mahasiswa sehingga menunjang proses perkuliahan serta perkembangan minat dan bakat mahasisya.
Beberapa fasilitas yang dimiliki yaitu :
- Lapangan
Lapangan yang disediakan yaitu lapangan basket, futsal, volly serta lapangan bulu tangkis.
- Asrama
Asrama mahasiswa STIKES Bethesda Yakkum diperuntukkan bagi mahasiswa luar daerah Yogyakarta
- Parkir
STIKES Bethesda Yakkum memiliki lahan parkir yang memadai bagi mahasiswa serta karyaan maupun tamu yang mungkin datang berkunjung ke kampus tercinta ini.
- Perpustakaan
STIKES Bethesda Yakkum memiliki perpustaakan dengan koleksi buku yang terdiri dari 5000+ eksemplar dan 2000+ judul, jurnal, majalah dan cd yang mampu menunjang proses pembelajaran bagi mahasiswa.
- Area atau ruang diskusi (student lounge)
Dalam upaya memberikan fasilitas terbaik untuk mendukung kegiatan mahasiswa, kampus STIKES Bethesda Yakkum menyediakan tempat diskusi bagi mahasiswa.
- Ruang kesehatan dan RS mitra
Dalam upaya memberikan pelayanan kesehatan kepada mahasiswa maka STIKES Bethesda Yakkum Yogyakarta menyediakan sarana untuk pertolongan Pertolongan Pertama Pada Kecelakaan (P3K), penyediaan obat sederhana dikampus. STIKES Bethesda Yakkum memiliki program pengelolaan dana sehat bagi mahasiswa. Dalam pelaksanaan pelayanan kesehatan bekerjasama dengan Rumah Sakit Bethesda Yogyakarta baik untuk rawat inap maupun rawat jalan.